ポケポケには、ミッションの達成条件をクリアしないと表示されないシークレットミッション（隠しミッション）があります。
この記事では、ポケポケのシークレットミッション一覧とそれらの達成条件および報酬を解説します。
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シークレットミッション一覧
| ミッション内容 | 報酬 |
|---|---|
| 最強の遺伝子ミュージアム① | ・チャレンジ砂時計 36個 ・パック砂時計 12個 ・ショップチケット 10個 |
| 最強の遺伝子ミュージアム② | ・チャレンジ砂時計 36個 ・パック砂時計 12個 ・ショップチケット 10個 |
| 最強の遺伝子ミュージアム③ | ・チャレンジ砂時計 36個 ・パック砂時計 12個 ・ショップチケット 10個 |
| 伝説のさらなる飛翔 | ・チャレンジ砂時計 48個 ・パック砂時計 12個 ・エンブレム（ファイヤー・フリーザー・サンダー） |
| カントー図鑑 完成！ | ・ミュウ（★3） |
| イマーシブ4 | ・チャレンジ砂時計 48個 ・パック砂時計 12個 ・ショップチケット 20個 |
| 図鑑にカードを226枚登録しよう | ・アイコン（ミュウツー） ・アイコン（リザードン） ・アイコン（ピカチュウ） |
シークレットミッションとは？
達成条件を達成しないと表示されない隠しミッションのことです。
シークレットミッションの達成条件と報酬
最強の遺伝子ミュージアム①
| 達成条件 | 最強の遺伝子 ミュウツーで手に入る★1カード全てを入手する |
| 報酬 | ・チャレンジ砂時計 36個 ・パック砂時計 12個 ・ショップチケット 10個 |
最強の遺伝子ミュージアム②
| 達成条件 | 最強の遺伝子 リザードンで手に入る★1カード全てを入手する |
| 報酬 | ・チャレンジ砂時計 36個 ・パック砂時計 12個 ・ショップチケット 10個 |
最強の遺伝子ミュージアム③
| 達成条件 | 最強の遺伝子 ピカチュウで手に入る★1カード全てを入手する |
| 報酬 | ・チャレンジ砂時計 36個 ・パック砂時計 12個 ・ショップチケット 10個 |
伝説のさらなる飛翔
| 達成条件 | 最強の遺伝子で手に入るファイヤー・フリーザー・サンダーの★2カード（アートイラスト版）全てを入手する |
| 報酬 | ・チャレンジ砂時計 48個 ・パック砂時計 12個 ・エンブレム（ファイヤー・フリーザー・サンダー） |
カントー図鑑 完成！
| 達成条件 | 初代ポケモン150種のカードを全て入手する |
| 報酬 | ・ミュウ（★3） |
イマーシブ4
| 達成条件 | イマーシブカード ミュウツー・リザードン・ピカチュウ・ミュウの4枚全てを入手する |
| 報酬 | ・チャレンジ砂時計 48個 ・パック砂時計 12個 ・ショップチケット 20個 |
図鑑にカードを226枚登録しよう
| 達成条件 | 拡張パック「最強の遺伝子」の図鑑を完成させる（イラスト違いを除く） |
| 報酬 | ・アイコン（ミュウツー） ・アイコン（リザードン） ・アイコン（ピカチュウ） |
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